Het ontrafelen van de ontwikkelingsgeschiedenis van kinderkanker

Het achterhalen van de cel van oorsprong van de tumor zal belangrijke aanwijzingen opleveren over de oorzaak van de ontwikkeling ervan, bijvoorbeeld een blokkade in de differentiatie. Het farmacologisch opheffen van een dergelijke blokkade zou een aantrekkelijke therapeutische interventie zijn (de zogenaamde maturatietherapie).

Om de oorsprong van tumoren te vinden, maken we gebruik van verschillende benaderingen. Ten eerste passen we DNA-sequencingtechnologieën toe om fylogenetische relaties te vinden tussen tumoren en normaal weefsel van hetzelfde individu. Hiervoor gebruiken we somatische mutaties als ‘barcodes’ om de oorsprong van de tumor te traceren. Ten tweede maken we gebruik van (single-cell) transcriptoom- en epigenoomsequencingbenaderingen, aangezien wij en anderen hebben aangetoond dat embryonale tumoren in grote mate de kenmerken van hun oorspronkelijke cellen weerspiegelen. Door tumor-transcriptoom met het transcriptoom van foetale weefselontwikkeling te vergelijken, willen we de cellulaire identiteit van de tumor ontrafelen.