Onderzoek naar de (epigenetische) processen die tumorinitiatie en -progressie aansturen

We zijn met name geïnteresseerd in de epigenoomveranderingen die optreden in pediatrische tumoren die uniek worden gedefinieerd door mutaties in leden van het SWI/SNF-complex. Door tumororganoïden te combineren met genbewerkingstechnologieën en (single-cell) omics-uitlezingen, willen we de tumorbevorderende signaalroutes identificeren die als therapeutische doelwitten kunnen dienen. Bovendien hebben we orthotope organoïde xenotransplantaatmodellen en barcode-afstammingsvolgstrategieën ontwikkeld waarmee we de klonale dynamiek tijdens de verschillende stappen van tumorontwikkeling (zoals primaire tumorgroei, metastasevorming en therapieresistentie) in detail kunnen bestuderen.

Naast tumororganoïden gebruiken we ook organoïden afkomstig van gezond weefsel voor het genereren van tumormodellen. We passen verschillende genoombewerkingstechnologieën (zoals CRISPR/Cas9-technologie) toe op gezonde organoïden om tumorprogressiemodellen te genereren. Dergelijke gemanipuleerde tumororganoïden bieden genetisch gedefinieerde modellen waarmee de bijdrage van specifieke genetische veranderingen aan tumorontwikkeling kan worden bestudeerd.